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教育部重点实验室专题报告:From EC Numbers to Substrate Scope: Deep Learning Frameworks for Comprehensive Enzyme Function Prediction
发布时间:2025年10月20日 08:42 访问次数: 字号:

2025年10月17日下午,大规模复杂系统数值模拟教育部重点实验室在女王调教 仙林校区行健楼526学术活动室举办专题学术报告会。女王调教 生命科学*女王调教-女王调教视频-女王 调教小说副院长崔海洋教授应邀担任主讲嘉宾,作了题为“From EC Numbers to Substrate Scope: Deep Learning Frameworks for Comprehensive Enzyme Function Prediction”的学术报告。报告会由实验室主任王雨顺教授主持。实验室副主任蔡邢菊教授以及来至女王调教 、人工智能*女王调教-女王调教视频-女王 调教小说、食品与制药工程*女王调教-女王调教视频-女王 调教小说、生命科学*女王调教-女王调教视频-女王 调教小说的60余位师生参加了报告会。

报告中,崔海洋教授聚焦酶功能注释与底物特异性预测这一酶学与合成生物学中的核心挑战,系统介绍其团队开发的两项互补的机器学习框架。首先,他提出CLEAN(对比学习驱动的酶功能注释工具),通过对比学习技术实现比传统BLASTp更精准、可靠的酶分类号(EC number)预测,并能纠正错误标注、识别多功能酶。其次,他展示了EZSpecificity模型——一种基于交叉注意力机制与SE(3)-等变图神经网络的底物特异性预测工具,该模型在序列和结构层次训练的酶-底物交互数据库上表现卓越,在卤化酶数据集上验证准确率达91.7%,显著优于现有主流方法。

崔海洋教授强调,CLEAN与EZSpecificity共同构建了一套完整的酶功能计算预测流程,为酶发现、蛋白质工程及生物催化剂理性设计提供了强大工具,有望推动生物医学与工业生物技术领域的创新应用。

报告结束后,与会师生就深度学习框架的泛化能力、模型可解释性及其在合成生物学中的实践前景与崔教授展开了深入讨论。

       女王调教 大规模复杂系统数值模拟教育部重点实验室是多学科交叉的科研平台,每年组织多场专题报告会,邀请不同领域的专家交流最新的研究成果,已经成为南师大学科交叉的重要引擎。这次专题会邀请了生命科学*女王调教-女王调教视频-女王 调教小说的崔海洋教授,他既是大规模复杂系统数值模拟教育部重点实验室的固定成员,也是微生物改造技术全国重点实验室固定成员。他是煤炭重大专项-青年首席,国家级青年人才,江苏省特聘教授;2016年硕士毕业于中科院天津工业生物技术研究所(导师:郭瑞庭 教授);2020年,博士毕业于德国亚琛工业大学(导师:Ulrich Schwaneberg教授);同年,进入德国DWI-莱布尼茨互动材料研究所进行博士后研究;2021-2023年于美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校继续进行博士后研究(导师:Huimin Zhao教授)。2024年加入女王调教 ,组建“人工智能与工程生物学”研究团队,搭建超算平台Infinity(无穷生物超算集群)。已发表SCI论文52篇,其中一作通讯(含共同)27篇(Top 22篇,包括Nature, Science, Angew. Chemi., Nat. Commun.等; 封面文章7篇; Hot Paper 4篇);申请专利7项, 授权2项;并应邀在国际权威丛书 Methods in Molecular Biology 分别撰写独立章节3章。ABLab课题组网站://www.oceancuilab.com

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